以前在檢測水中總大腸菌群時，一般都采用的是多管發酵法，這種方法，不僅檢測時間長，而且培養基保存的時間短，陽性結構需要驗證試驗，操作步驟較為繁瑣。而酶底物法檢測方法以快速簡便的特點彌補了傳統方法的不足。酶底物法測總大腸菌群方法已在許多國家使用。
其實酶底物法與多管發酵法都是檢測水中大腸菌群，結果差異無統計學意義上，說明多管發酵法和酶底物法均可用于生活飲用水中大腸菌群的定量測定。酶底物法與多管發酵法相比具有明顯的優點。酶底物法操作簡便，可以在24h內報告結果，且無需確認試驗，大大地節省了人力物力。
此外，可同時檢測水中大腸菌群和大腸埃希氏菌，能夠較為準確地判定水樣被糞便污染的情況，能夠更好地滿足突發事件及日常檢測工作的要求。